Ποινική δίωξη κατά παντός υπευθύνου, για απόπειρα διακεκριμένης κατασκοπίας, ασκήθηκε για την υπόθεση των υποκλοπών που είχε αποκαλυφθεί τον Ιανουάριο του 2006, από την εισαγγελία Πρωτοδικών της Αθήνας.
Ο φάκελος θα ανατεθεί σε τακτικό ανακριτή ο οποίος θα κληθεί να προσωποποιήσει την κατηγορία σε βάρος των συγκεκριμένων ατόμων που φέρονται να εμπλέκονται.
Η υπόθεση αυτή πριν από δέκα μήνες ανασύρθηκε από το αρχείο όπου είχε τεθεί ως αγνώστων δραστών μετά την επιστολή του σημερινού υπουργού Δικαιοσύνης, Μιλτιάδη Παπαϊωάννου, προς την εισαγγελία του Αρείου Πάγου ο οποίος με την ιδιότητα του τότε προέδρου της επιτροπής Θεσμού και Διαφάνειας της Βουλής, έκανε λόγο για γκρίζες ζώνες στην προανάκριση και στοιχεία που δεν είχαν αξιολογηθεί.
Από τα στοιχεία που συγκέντρωσε ο εισαγγελικός λειτουργός, ωστόσο, προέκυψαν ενδείξεις για την πιθανή εμπλοκή περισσοτέρων από ενός στελεχών της αμερικανική πρεσβείας στην υπόθεση των υποκλοπών, από τον Ιούλιο 2004 έως το Φεβρουάριο 2005.